ძირითადი საქმიანობა ღვინის ეროვნული სააგენტო საქართველოს სოფლის მეურნეობის სამინისტროს მმართველობის სფეროში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირია, რომელიც შექმნილია „ვაზისა და ღვინის შესახებ“ საქართველოს კანონის საფუძველზე. სააგენტოს უფლება-მოვალეობები და ფუნქციებია: მევენახეობა-მეღვინეობის დარგების რეგულირება; ფალსიფიცირებული პროდუქციისგან სამომხმარებლო ბაზრის დაცვა; ვაზის სადედეების, სამყნობი მასალებისა და ნამყენი ნერგის წარმოებასა და გაშენებაზე ზედამხედველობა, ტექნიკური და ფიტოსანიტარული კონტროლის განხორციელება; მევენახეობა-მეღვინეობის დარგების ფუნქციონირებისა და განვითარებისთვის წინადადებებისა და რეკომენდაციების მომზადება; ადგილწარმოშობის დასახელების ღვინოებსა და ღვინის ბრენდებზე სახელმწიფო კონტროლის განხორციელება; ყურძნისეული წარმოშობის ალკოჰოლიან სასმელებზე შესაბამისობისა და წარმოშობის სერტიფიკატების გაცემა; ყურძნისეული წარმოშობის ალკოჰოლიანი სასმელების ეტიკეტირება და მისი კონტროლი; მევენახეობისა და მეღვინეობის საერთაშორისო და ეროვნულ ორგანიზაციებთან ურთიერთობა;  დარგთან დაკავშირებული სამარკეტინგო და სარეკლამო საქმიანობა; ალკოჰოლიანი სასმელების დეგუსტაციების, კონკურსების, გამოფენებისა და სემინარების მოწყობის ხელშეწყობა; სააგენტოსთან შექმნილი მუდმივმოქმედი სადეგუსტაციო კომისიის ფუნქციონირების უზრუნველყოფა; ადმინისტრაციულ სამართალდარღვევათა საქმეების განხილვა კანონით მინიჭებული უფლებამოსილების ფარგლებში. სააგენტოს საქმიანობის ძირითადი მიმართულებებია: ქართული ღვინის პოპულარიზაცია და ცნობადობის ამაღლება; საექსპორტო პოტენციალის ზრდის ხელშეწყობა; ქართული ვაზისა და ღვინის კულტურის კვლევა და პოპულარიზაცია; ვაზის უნიკალური და იშვიათი ქართული ჯიშების აღდგენის ხელშეწყობა; ვენახების საკადასტრო უწყებრივი რეესტრის შექმნა; ქვევრის ღვინის დაყენების უძველესი ქართული ტრადიციული მეთოდების პოპულარიზაცია; ღვინის ტურიზმის განვითარების ხელშეწყობა. ღვინის ეროვნული სააგენტო თავის საქმიანობას ახორციელებს სოფლის მეურნეობის სამინისტროსთან მუდმივი კონტაქტისა და საქართველოს შესაბამის სახელმწიფო და მეღვინეობის სფეროში მოქმედ კერძო კომპანიებთან თანამშრომლობის რეჟიმში.